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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/13 |
課程介紹（胡凱康），科學文獻蒐集與管理（圖書館），科學文獻閱讀與報告寫作（黃永芬） |
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第2週 |
9/20 |
簡單重複序列 (SSR) 基因型定型分析實驗（胡凱康） |
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第3週 |
9/27 |
Introduction of crop genome, tools used to study crop genomes
SNP-based marker development I (董致韡) |
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第4週 |
10/4 |
SNP-based marker development II (董致韡)
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第5週 |
10/11 |
(1) Genotyping-by-sequencing
(2) Analyzing, characterization of crop genomes and association study (董致韡) |
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第6週 |
10/18 |
(1) Analyzing, characterization of crop genomes and association study (董致韡)
(2) SNP基因型定型分析實驗I--KASP（董致韡)
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第7週 |
10/25 |
Marker-assisted breeding (董致韡) |
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第8週 |
11/1 |
SNP基因型定型分析實驗II--TaqMan & rhAmp（胡凱康） |
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第9週 |
11/8 |
高通量 SNP 基因型分析平台 -ddRAD (胡凱康) |
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第10週 |
11/15 |
GATK best practice workflow (胡凱康) |
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第11週 |
11/22 |
R / Variant Annotation 解讀 VCF (胡凱康) |
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第12週 |
11/29 |
R/qtl (黃永芬) |
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第13週 |
12/6 |
R/qtl (黃永芬) |
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第14週 |
12/13 |
R/qtl (黃永芬) |
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第15週 |
12/20 |
R/qtl （黃永芬） |
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第16週 |
12/27 |
期末報告（黃永芬） |
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第17週 |
1/3 |
Galaxy / Stacks 介紹與實作 (陳凱儀) |